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  • Ce que la génomique fonctionnelle peut apporter à la filière viande bovine.

    J.F. HOCQUETTE, I. CASSAR-MALEK, A. LISTRAT, B. PICARD

    INRA Centre de Clermont-Ferrand/Theix, Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Equipe Croissance et Métabolismes

    du Muscle (C2M), 63122 Saint-Genès Champanelle.

    RESUME

    Les caractéristiques musculaires qui déterminent la qualité de la viande bovine dépendent du patrimoine génétique des animaux et des conditions d’élevage (nutrition, mode de conduite). Notre approche de la biologie musculaire a été fortement changée par la génomique. La génomique fonctionnelle est en effet une nouvelle méthode d’investigation du vivant, basée sur le développement de techniques à grande échelle (séquençage de l’ADN, analyse de l’expression des gènes) et permettant l’analyse simultanée de centaines de gènes. Ces techniques permettent en effet une vision globale des caractéristiques de l’ensemble des gènes exprimés dans le muscle. La stratégie scientifique la plus porteuse d’avenir est certainement l’intégration des connaissances en combinant les résultats issus de la génomique avec des données de biologie musculaire et avec des informations relatives à la qualité finale de la viande. Concrètement, la génomique fonctionnelle permettra ainsi d’identifier de nouveaux gènes qui expliquent la variabilité des caractéristiques du muscle et de la qualité de la viande bovine. Si l’importance de ces gènes est due à leur polymorphisme, ils pourront être utilisés pour améliorer la sélection génétique des reproducteurs. Si l’importance de ces gènes est liée à une régulation de leur expression par des facteurs environnementaux, leur expression pourra être maîtrisée par les facteurs d’élevage (niveau et nature de l’alimentation, mode de conduite,...) afin d’améliorer la qualité de la viande. Dans les deux cas, les techniques de génomique seront très probablement automatisées pour être, à moyen terme, utilisables en routine pour la filière. Les premières études de génomique réalisées à ce jour ouvrent effectivement de nouvelles perspectives pour atteindre ces objectifs.

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    3R 2003 - Séance :

    Génomique

    Les approches génomiques pour l’identification de gènes d’intérêt économique : outils, applications et perspectives. 

    A. EGGEN

    Exploitation des gènes de la coloration de la robe pour une traçabilité raciale des produits d’origine bovine. 

    M. GIRARDOT, S. GUIBERT, M.P. LAFORET, H. LEVEZIEL, R. JULIEN, A. OULMOUDEN

    Etude du gène de la calpastatine chez les bovins. 

    P. RAYNAUD, P. PELISSIER, L. BREMAUD, V. AMARGER, R. JULIEN, A. OUALI, H. LEVEZIEL

    Cartographie fine d’un QTL intervenant sur la fertilité femelle chez les bovins laitiers. 

    M. GAUTIER, S. FRITZ, C. GROHS, D. BOICHARD, A. EGGEN

    Utilisation de la Génomique pour l’étude de la phase d’élongation de l’embryon bovin. 

    S. DEGRELLE, I. HUE, K. PIOT, F. PIUMI, C. RICHARD, X. VIGNON, JP. RENARD

    Analyse de l’expression de gènes indicateurs de la mort cellulaire dans la glande mammaire, un indice du potentiel de production de la glande mammaire. 

    M. BOUTINAUD, J. GUINARD-FLAMENT, H. JAMMES

    Mise en place d’une sélection assitée par marqueurs dans les trois principales races bovines laitières françaises. 

    S. FRITZ, J.J. COLLEAU, T. DRUET, M.Y. BOSCHER, M.N. ROSSIGNOL, A. MALAFOSSE, D. BOICHARD

    Détection de QTL influençant des caractères d’importance économique présente ou à venir en ovins laitiers en France et en Italie. 

    F. BARILLET, A. CARTA, D. ALLAIN, Y. AMIGUES, L. BODIN, Sara CASU, E.P. CRIBIU, B. BED’HOM, D. BOICHARD, M.Y. BOSCHER, J.M. ELSEN, A. FRAGHI, L. GRUNER, P. JACQUIET,

    S. LIGIOS, C. MARIE-ETANCELIN, L. MURA, G. PIREDDA, A. ROIG, R. RUPP, S.R. SANNA, A. SCALA, L. SCHIBLER, T. SECHI, S. CASU

    Affiche • Une expérimentation en croisement pour détecter des QTL chez les bovins laitiers. 

    H. LARROQUE, Y. GALLARD, D. BOICHARD, J.J. COLLEAU

    Affiche • ROGER : Un Répertoire Ordonné de Gènes pour l’analyse de l’Expression génique chez les Ruminants. Application à l’identification de marqueurs de la différenciation dans le muscle, le tissu adipeux, l’embryon et la glande mammaire. 

    P. MARTIN, J.F. HOCQUETTE, I. HUE, C. LEROUX, S. POLLET, F. LE PROVOST, K. SUDRE, S. DEGRELLE, G. ROLLAND, E. ZALACHAS, I. CASSAR-MALEK, C. VELTRI, F. LEPAGE, A. LISTRAT, M. BONNET, E. PETIT, J. LAUBIER, M. GRAZIANO, F. PIUMI, Y. CHILLIARD, J.P. RENARD, P. CHARDON

    Affiche • Analyse d’image de filtres à haute densité : méthodes d’acquisition et de traitement. 

    B. MEUNIER, K. SUDRE, I. CASSAR-MALEK, A. LISTRAT, J-F. HOCQUETTE

    Affiche • L’importance de la variabilité biologique et de la précision des mesures en biologie intégrative. 

    J.F. HOCQUETTE, C. JURIE, A. LISTRAT, I. CASSAR-MALEK

    Affiche • Importance de la méthode d’analyse statistique des données du transcriptome. 

    J.F. HOCQUETTE, I. BARNOLA, C. BERNARD, B. MEUNIER, K. SUDRE, A. LISTRAT, I. CASSAR-MALEK

    Affiche • Mesure du taux d’incompatibilité des génisses issues de taureaux de testage et incidence sur le protocole de testage. 

    H. LEDOS, S. MOUREAUX, P. LE MEZEC

    Affiche • La syndactylie en race Holstein : identification de marqueurs génétiques et caractérisation de gènes candidats. Vers une éradication de l’anomalie dans nos cheptels. 

    A. DUCHESNE, M. GAUTIER, C. GROHS, F. LE PROVOST, I. HUE, Y. GALLARD, H. LARROQUE, A. DUCOS, A. EGGEN

    Affiche • Premiers résultats du programme français d’amélioration génétique des ovins pour la résistance à la tremblante. 

    I.PALHIERE, M. BROCHARD, Membres du comité de suivi du programme

    Affiche • Cartographie des protéines du muscle Semitendinosus de bovins par électrophorèse bidimensionnelle et spectrométrie de masse. 

    J. BOULEY, C. CHAMBON, B. PICARD

    Affiche • Validation d’un répertoire d’ADNc de muscles de bovins : application à la recherche de gènes marqueurs de la croissance musculaire. 

    A. LISTRAT, K. SUDRE, I. CASSAR-MALEK, Y. UEDA, I. BARNOLA, G. ROLLAND, C. JURIE, C. LEROUX, G. GENTES, G. RENAND, P. MARTIN, J.F. HOCQUETTE

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