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Hétérogénéité génomique dans le gène pol du lentivirus ovin visna-mædi

LEROUX C., VUILLERMOZ S., GREENLAND T., MORNEX J.F.

Laboratoire associé de recherches sur les lentivirus chez les petits ruminants INRA et Ecole vétérinaire,

Laboratoire d’immunologie et de biologie pulmonaire.

INSERM CJF 93-08, et service de pneumologie.

Hôpital Louis Pradel BP Lyon Montchat 69394 Lyon Cedex 03.

RESUME

Nous avons analysé 6 isolats de terrain de virus visna-mædi, obtenus à partir de macro- phages alvéolaires de moutons spontanément infectés et présentant des lésions de mædi. L’ARN viral a été amplifié par RT-PCR avec des amorces spécifiques des gènes pol et env. Les fragments d’ADN obtenus ont été clonés puis séquencés. Dans pol, six isolats ont des séquences nucléotidiques très proches avec des taux de divergence de 3 à 10% (3 à 4% en acides aminés) lorsqu’ils sont comparés les uns aux autres, de 14 à 16% avec la souche CAEV Cork (4 à 8% en acides aminés) et de 16 à 19% avec la souche visna K1514 (11 à 13% en acides amin6s). Le sixième isolat montre autant de divergence avec CAEV cork (21% en nucléotides et 13% en acides aminés) que K1514 (16% en nucléotides et 15% en acides aminés). Dans env, I’analyse des fragments obtenus par digestion avec différentes enzymes de restriction montre des différences entre les six isolats et avec les souches CAEV et K1514.

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