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2206. Génétique

Bovins laitiers | Génétique | Santé animale

Identification de régions du génome et de gènes candidats associés au niveau de réponse immune innée de veaux Holstein

MARTIN P. (1), JOUNEAU L. (2), TAUSSAT S. (3), VINET A. (1), LEFEBVRE R. (1), DESCAMPS D. (2), FERRET C. (2), CHOTTIN C. (2), PIETRALUNGA V. (2), PEZIER T. (4), LACROIX-LAMANDE S. (4), BOUSSAHA M. (1), BARBEY S. (5), DENIZOT V. (6), BOICHARD D. (1), RIFFAULT S. (2), LAURENT F. (4)

(1) Université Paris‐Saclay, INRAE, AgroParisTech, GABI, 78350, Jouy‐en‐Josas, France
(2) Université Paris‐Saclay, INRAE, UVSQ, VIM, 78350, Jouy‐en‐Josas, France
(3) Allice, 149 rue de Bercy, 75012, Paris, France
(4) INRAE, UMR1282 Infectiologie et Santé Publique, 37380 Nouzilly, France
(5) INRAE, UE326 Domaine Expérimental du Pin, 61310 Gouffern en Auge, France
(6) Innoval, GDS Bretagne, 35538 Noyal-sur-Vilaine, France

RESUME

Afin d’étudier le contrôle génomique de la réponse immune innée, les concentrations de 14 cytokines ont été déterminées grâce à un kit multiplex dans quatre échantillons de sang pour chacun des 623 veaux Holstein du projet Healthycalf. Trois de ces échantillons avaient été mis au contact d’agonistes mimant l’exposition à des pathogènes et le dernier mesurait les niveaux de cytokines présents à l’état basal. L’effet de l’immunostimulant et les relations entre les concentrations cytokiniques ont été étudiés par une analyse en composantes principales, puis des analyses d’association tout génome 50k ont été effectuées. Les résultats montrent que les niveaux de la plupart des cytokines sont très associés les uns aux autres avec un premier axe de l’ACP qui explique plus de 70% de la variabilité. Ce même axe discrimine la condition de stimulation. De plus, 40 régions du génome ont été identifiées comme associées à au moins un caractère, dont certaines sont largement partagées entre plusieurs cytokines. Sept gènes de ces régions ont déjà été associés à la réponse immune innée dans d’autres espèces.

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