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Génétique | Génomique | Ruminants (général)
Analyse d’image de filtres à haute densité : méthodes d’acquisition et de traitement.
B. MEUNIER, K. SUDRE, I. CASSAR-MALEK, A. LISTRAT, J-F. HOCQUETTE
INRA, Unité de Recherches sur les Herbivores, 63122 St-Genès-Champanelle, France
INTRODUCTION
L’analyse du transcriptome est basée sur l’hybridation moléculaire de cibles complexes (ARN extraits d’un tissu, rétrotrancrits et marqués) avec un grand nombre de sondes (ADNc correspondant à des fragments de gènes) préalablement déposées sur un support (lame de verre, membrane de Nylon). Les résultats apparaissent sous la forme de « spots » dont l’intensité correspond au niveau d’expression des gènes. L’acquisition de l’image de ces spots est réalisée par un scanner et l’analyse de l’image est généralement effectuée par un logiciel dédié. Le premier objectif de ce travail est de donner quelques recommandations concernant le dépôt des ADNc sur le support, l’acquisition et l’analyse de l’image pour optimiser la qualité des résultats. Ensuite quelques techniques d’extraction des données déclarées fiables sont illustrées par des exemples présentant des biais différents.
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3R 2003 - Séance : Génomique
Les approches génomiques pour l’identification de gènes d’intérêt économique : outils, applications et perspectives.
A. EGGEN
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3R 2003 - Séance : Génomique
Ce que la génomique fonctionnelle peut apporter à la filière viande bovine.
J.F. HOCQUETTE, I. CASSAR-MALEK, A. LISTRAT, B. PICARD
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3R 2003 - Séance : Génomique
Exploitation des gènes de la coloration de la robe pour une traçabilité raciale des produits d’origine bovine.
M. GIRARDOT, S. GUIBERT, M.P. LAFORET, H. LEVEZIEL, R. JULIEN, A. OULMOUDEN
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3R 2003 - Séance : Génomique
Etude du gène de la calpastatine chez les bovins.
P. RAYNAUD, P. PELISSIER, L. BREMAUD, V. AMARGER, R. JULIEN, A. OUALI, H. LEVEZIEL
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3R 2003 - Séance : Génomique
Cartographie fine d’un QTL intervenant sur la fertilité femelle chez les bovins laitiers.
M. GAUTIER, S. FRITZ, C. GROHS, D. BOICHARD, A. EGGEN
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3R 2003 - Séance : Génomique
Utilisation de la Génomique pour l’étude de la phase d’élongation de l’embryon bovin.
S. DEGRELLE, I. HUE, K. PIOT, F. PIUMI, C. RICHARD, X. VIGNON, JP. RENARD
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3R 2003 - Séance : Génomique
Analyse de l’expression de gènes indicateurs de la mort cellulaire dans la glande mammaire, un indice du potentiel de production de la glande mammaire.
M. BOUTINAUD, J. GUINARD-FLAMENT, H. JAMMES
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3R 2003 - Séance : Génomique
Mise en place d’une sélection assitée par marqueurs dans les trois principales races bovines laitières françaises.
S. FRITZ, J.J. COLLEAU, T. DRUET, M.Y. BOSCHER, M.N. ROSSIGNOL, A. MALAFOSSE, D. BOICHARD
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3R 2003 - Séance : Génomique
Détection de QTL influençant des caractères d’importance économique présente ou à venir en ovins laitiers en France et en Italie.
F. BARILLET, A. CARTA, D. ALLAIN, Y. AMIGUES, L. BODIN, Sara CASU, E.P. CRIBIU, B. BED'HOM, D. BOICHARD, M.Y. BOSCHER, J.M. ELSEN, A. FRAGHI, L. GRUNER, P. JACQUIET, S. LIGIOS, C. MARIE-ETANCELIN, L. MURA, G. PIREDDA, A. ROIG, R. RUPP, S.R. SANNA, A. SCALA, L. SCHIBLER, T. SECHI, S. CASU
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Affiche •
3R 2003 - Séance : Génomique
Une expérimentation en croisement pour détecter des QTL chez les bovins laitiers.
H. LARROQUE, Y. GALLARD, D. BOICHARD, J.J. COLLEAU
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Affiche •
3R 2003 - Séance : Génomique
ROGER : Un Répertoire Ordonné de Gènes pour l’analyse de l’Expression génique chez les Ruminants. Application à l’identification de marqueurs de la différenciation dans le muscle, le tissu adipeux, l’embryon et la glande mammaire.
P. MARTIN, J.F. HOCQUETTE, I. HUE, C. LEROUX, S. POLLET, F. LE PROVOST, K. SUDRE, S. DEGRELLE, G. ROLLAND, E. ZALACHAS, I. CASSAR-MALEK, C. VELTRI, F. LEPAGE, A. LISTRAT, M. BONNET, E. PETIT, J. LAUBIER, M. GRAZIANO, F. PIUMI, Y. CHILLIARD, J.P. RENARD, P. CHARDON
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Affiche •
3R 2003 - Séance : Génomique
L’importance de la variabilité biologique et de la précision des mesures en biologie intégrative.
J.F. HOCQUETTE, C. JURIE, A. LISTRAT, I. CASSAR-MALEK
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Affiche •
3R 2003 - Séance : Génomique
Importance de la méthode d’analyse statistique des données du transcriptome.
J.F. HOCQUETTE, I. BARNOLA, C. BERNARD, B. MEUNIER, K. SUDRE, A. LISTRAT, I. CASSAR-MALEK
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Affiche •
3R 2003 - Séance : Génomique
Mesure du taux d’incompatibilité des génisses issues de taureaux de testage et incidence sur le protocole de testage.
H. LEDOS, S. MOUREAUX, P. LE MEZEC
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Affiche •
3R 2003 - Séance : Génomique
La syndactylie en race Holstein : identification de marqueurs génétiques et caractérisation de gènes candidats. Vers une éradication de l’anomalie dans nos cheptels.
A. DUCHESNE, M. GAUTIER, C. GROHS, F. LE PROVOST, I. HUE, Y. GALLARD, H. LARROQUE, A. DUCOS, A. EGGEN
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Affiche •
3R 2003 - Séance : Génomique
Premiers résultats du programme français d’amélioration génétique des ovins pour la résistance à la tremblante.
I.PALHIERE, M. BROCHARD, Membres du comité de suivi du programme
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Affiche •
3R 2003 - Séance : Génomique
Cartographie des protéines du muscle Semitendinosus de bovins par électrophorèse bidimensionnelle et spectrométrie de masse.
J. BOULEY, C. CHAMBON, B. PICARD
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Affiche •
3R 2003 - Séance : Génomique
Validation d’un répertoire d’ADNc de muscles de bovins : application à la recherche de gènes marqueurs de la croissance musculaire.
A. LISTRAT, K. SUDRE, I. CASSAR-MALEK, Y. UEDA, I. BARNOLA, G. ROLLAND, C. JURIE, C. LEROUX, G. GENTES, G. RENAND, P. MARTIN, J.F. HOCQUETTE